Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms