Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms