Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms