Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms