Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms