Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Scn1bP97952 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scn1bP97952 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms