Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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