Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms