Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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