Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms