Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms