Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf5P70191 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf5P70191 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms