Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps3P62908 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms