Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SnnP61807 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SnnP61807 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SnnP61807 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SnnP61807 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SnnP61807 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SnnP61807 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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SnnP61807 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SnnP61807 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SnnP61807 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SnnP61807 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
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SnnP61807 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SnnP61807 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SnnP61807 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SnnP61807 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SnnP61807 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SnnP61807 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SnnP61807 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SnnP61807 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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SnnP61807 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnnP61807 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms