Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b6P59708 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms