Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms