Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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