Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpa1P57784 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms