Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcstnP57716 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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