Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmoP56726 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
SmoP56726 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SmoP56726 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SmoP56726 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmoP56726 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms