Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FmodP50608 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FmodP50608 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FmodP50608 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FmodP50608 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FmodP50608 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FmodP50608 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FmodP50608 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FmodP50608 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FmodP50608 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms