Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms