Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrprbP47758 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrprbP47758 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrprbP47758 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SrprbP47758 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrprbP47758 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrprbP47758 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrprbP47758 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrprbP47758 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SrprbP47758 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrprbP47758 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrprbP47758 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms