Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms