Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik2P39087 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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