Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lig1P37913 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lig1P37913 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lig1P37913 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lig1P37913 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Lig1P37913 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Lig1P37913 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Lig1P37913 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lig1P37913 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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