Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms