Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms