Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp4P35123 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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