Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tfap2aP34056 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms