Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SsbP32067 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SsbP32067 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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