Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VtnP29788 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VtnP29788 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VtnP29788 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VtnP29788 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VtnP29788 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms