Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NapbP28663 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NapbP28663 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NapbP28663 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms