Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PdgfraP26618 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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