Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RdxP26043 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RdxP26043 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RdxP26043 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RdxP26043 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RdxP26043 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RdxP26043 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RdxP26043 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RdxP26043 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms