Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PparaP23204 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PparaP23204 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PparaP23204 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PparaP23204 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PparaP23204 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PparaP23204 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PparaP23204 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PparaP23204 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PparaP23204 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PparaP23204 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PparaP23204 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PparaP23204 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PparaP23204 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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