Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3P21107 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3P21107 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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