Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VimP20152 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VimP20152 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms