Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms