Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18530 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18530 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms