Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms