Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calm3P0DP28 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calm3P0DP28 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms