Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UbbP0CG49 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms