Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mtatp6P00848 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms