Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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