Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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