Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms