Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms