Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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