Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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Gm20878L7N244 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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